Официальная заявка «ЭНКА Системс» на создание Центра исследований и разработок была подана 8 декабря 2017 года, и Министерством науки, промышленности и технологий компания объявлена Центром исследований и разработок.
Компания «ЭНКА Системс» была образована в 2017 г. как дочернее предприятие компании «ЭНКА» для удовлетворения потребностей в программном обеспечении компаний, осуществляющих крупномасштабные, глобальные проекты.